由于地质变迁和气候变化，特别是第四纪冰期的影响，加之大量森林被破坏，濒临绝灭。脆弱环境中“避难”引起我国植物学家及各界有识之士的重视和焦虑。 粗齿桫椤濒危的原因主要有以下几方面：
1、粗齿桫椤成年株每年产生孢子数量多，但死亡也多。
2、在自然界，有幸存活的孢子，从萌发至形成幼孢子体这一过程，费时达1年以上，湿度、温度等生态因子的变化，都可能 影响萌发孢子的生死存亡或延迟以后的发育进程。
3、粗齿桫椤孢子萌发，形成配子体胚胎等过程对环境要求严格，发育对环境有严重的依赖性，限制了它只能在一定孤立的区域生栖繁衍，而成年株在周围5米范围内也限制了生长粗齿桫椤幼株，因此适宜生长的区域更小了。尽管粗齿桫椤偶尔也能侵入并幸存在新的森林区域，但它竞争不过当地迅速生长的植物。
4、粗齿桫椤是木本生植物，生殖周期很长，生殖过程在离体情况下进行，发育进程完全受变化的环境控制，不利于生存发展。
5、粗齿桫椤无完善的根系，很难适应现存变化较大的生态环境。
6、由于原始森林逐年破坏，粗齿桫椤赖以生存的温暖、潮湿、荫蔽、水分充足、土层肥厚和排水良好的环境受到毁坏或消失，粗齿桫椤本身也就受到威胁或毁灭。
7、人为直接砍伐，使生长数年的或几十年的桫椤毁于一旦，近年来，不法分子盗挖盗卖桫椤等现象也时有发生。
