苏-35BM跟标准的苏-27S气动布局类似，而完全不同于旧苏-35/T10M。与后者相比，苏-35BM取消了前翼，垂尾改回苏-27标准的切角状，尾锥也要小一些（估计是新一代后视雷达体积缩小的缘故），机翼后缘为全翼展襟副翼。该机采用了全新的内部机体结构，大量使用复合材料，据称重量比苏-27SM减轻了约20%；考虑到旧苏-35的前翼和机身结合部是个强雷达反射源，因此苏-35BM放弃了前翼（也可根据客户需要选装），但由于采用了更先进的姿态控制技术，加上机头段新设备的重量有所减轻，不需要气动作用有限的前翼来配平，因此空中机动性毫不逊色于旧苏-35，而取消前翼后全机雷达反射截面积（RCS）也大大减少；由于发动机推力增加，苏-35BM所需要的进气流量也需要增加，所以苏-35BM的进气口面积较大；新旧苏-35外形上最为相似的部分是机头段，两者座舱的位置比标准苏-27S都要低矮，很明显是出于隐身考虑；另外，苏-35BM的雷达罩上有10条防雷条，这在俄罗斯飞机上也是首见。
