1722年，牛顿已经80岁了，在这年里，他的行动越来越不方便，身体状况也比以前差得多。在朋友的劝说下，他请来了颇有名望的医生。原来牛顿患了当时还没有什么有效治疗方法的膀胱结石，只能暂时尝试用食物疗法来减轻痛苦。不过牛顿并没有坐以待毙，他积极地配合家人，每日严格遵照外甥女为他安排的食谱进餐。
功夫不负有心人，两年的精心调养有了成效。1724年8月，有两粒豆大的结石被排了出来。但好景不长，1725年初，他又染上了肺病及风湿病，牛顿只好再次接受医生和朋友的劝告，移居到肯辛顿休养。这里环境幽雅，空气清新，最适合静心休养。牛顿在这样恬静悠闲的生活里，每天呼吸着新鲜的空气。
在肯辛顿修养了一阵子后，牛顿的身体渐渐复原了，于是，他又回到了伦敦。但没几天，难忍的病痛再次袭来，牛顿不得又再次返回肯辛顿。返回肯辛顿后，他的病情开始恶化。当医生来看他时，他的病情已到了无可挽救的地步。
3月15日，疼痛出乎意料地减轻了许多，牛顿感觉稍稍舒服了点。18日早晨，他竟然能坐在床上看报纸了，还和医生聊了很久，精神状态相当好。但是，就在当天晚上，他变得神志不清了，他虚弱的身体安静地躺在那儿，一动不动。
1727年3月20日凌晨一点一刻，伊萨克•牛顿在睡梦中安然死去，享年85岁。
